如何選擇到適合自己實(shí)驗(yàn)的抗體
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抗體圖片:
抗體
一、關(guān)于特異性的選擇:特異性的選擇主要需要考慮四個(gè)方面:蛋白特異性、種屬特異性、實(shí)驗(yàn)方法特異性、標(biāo)記物的特異性。
1、蛋白特異性:針對需要檢測的蛋白查找抗體,幾個(gè)細(xì)節(jié)要區(qū)分,重組表達(dá)的蛋白和內(nèi)源性蛋白的檢測,對抗體的要求是不一樣的,注意查看抗體說明書的檢測說明。如果重組蛋白不是全長表達(dá),則需要注意抗體的免疫原區(qū)域是否在重組蛋白區(qū)域內(nèi)。內(nèi)源性蛋白能清楚其剪切與修飾的方式,特殊表型的蛋白需要進(jìn)行序列比對,并結(jié)合抗體免疫原序列,查看交叉反應(yīng)的情況。磷酸化蛋白檢測需要確定具體位點(diǎn),不同位點(diǎn)的磷酸化意味著可能有不同的機(jī)制存在,不宜一概而論。
2、種屬特異性:同種蛋白不同物種,有著或大或小的差異。目前大部分商品化抗體都是以人源蛋白序列為模板重組蛋白或設(shè)計(jì)多肽抗原的,根據(jù)蛋白的同源性的情況與其他種屬發(fā)生交叉反應(yīng)。需要參照說明書注明的可反應(yīng)種屬信息。一些稀有種屬很難找到抗體,可以通過蛋白的序列比對,選擇同源序列免疫的抗體,不過一般這種情況生產(chǎn)商不會(huì)受理其關(guān)于質(zhì)量的申訴,如果可以申請到免費(fèi)的抗體樣品,則利于抗體選擇。
3、實(shí)驗(yàn)方法特異性:目前使用抗體的實(shí)驗(yàn)方法有很多,不同的使用方法過程中,因?yàn)閷Φ鞍讟悠返奶幚矸绞讲灰粯樱鞍椎暮坑胁町?,對抗體的識(shí)別表位和效價(jià)要求都是不一樣的。具體的根據(jù)說明書注明的產(chǎn)品應(yīng)用方法進(jìn)行選擇。但是生產(chǎn)商一般不會(huì)將每個(gè)抗體都進(jìn)行各種實(shí)驗(yàn)的檢測,目前檢測比較多的只是WB、IHC、IF等,如果針對具體的實(shí)驗(yàn)方法沒有找到合適的抗體的,可以結(jié)合蛋白序列分析和抗體的抗原信息,選擇盡可能有效果的抗體。同樣,申請到免費(fèi)的抗體樣品是個(gè)很好的途徑。
4、標(biāo)記物的特異性一般基于實(shí)驗(yàn)操作的實(shí)驗(yàn)方法不會(huì)使用帶有標(biāo)記的一抗,比如WB、IHC等,都是通過二抗類的試劑標(biāo)記達(dá)到結(jié)果呈現(xiàn)的目的。但是基于儀器分析的一些實(shí)驗(yàn),可能就會(huì)使用到直接標(biāo)記的一抗,比如流式實(shí)驗(yàn)。那么需要了解到自己將要使用的儀器能檢測到的熒光范圍,不通的參數(shù)要求選擇對應(yīng)的標(biāo)記物。在免疫熒光雙標(biāo)實(shí)驗(yàn)中,需要選配不同的熒光物。
二、抗體種屬來源的選擇:有人認(rèn)為單抗比多抗好,其實(shí)這并不是一個(gè)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)挠^點(diǎn),只能說在可能性上單抗的特異性更好一些,而多抗的親和力會(huì)優(yōu)于單抗,并且特異性并不一定就遜于單抗,主要看抗原的設(shè)計(jì)水平。目前商品化抗體里單抗主要是鼠單抗、兔單抗,多抗主要是兔多抗、山羊多抗等,其他種屬來源抗體較少。不建議糾結(jié)于單抗好還是多抗好,能做出實(shí)驗(yàn)的抗體就是好抗體。在選擇上一般建議實(shí)驗(yàn)種屬和抗體種屬親緣性越遠(yuǎn)越好,不宜同源。抗體不同種屬會(huì)要影響接下來二抗的選配。特別是在免疫熒光雙標(biāo)實(shí)驗(yàn)中,需要在區(qū)別于實(shí)驗(yàn)種屬的基礎(chǔ)上,區(qū)分開兩個(gè)指標(biāo)的抗體種屬來源,以便于二抗區(qū)別識(shí)別。
三、關(guān)于性價(jià)比的選擇:抗體的品質(zhì)高低zui終還是需要通過實(shí)驗(yàn)結(jié)果來呈現(xiàn)的,但是在選擇抗體之前我們并無法準(zhǔn)確判斷抗體的效果如何。無論什么品牌的,無論進(jìn)口還是國產(chǎn)的,都會(huì)有用得不錯(cuò)的產(chǎn)品,也都會(huì)有做不出來的產(chǎn)品??贵w屬于異質(zhì)化產(chǎn)品,不同品牌之間,甚至同一品牌的不同產(chǎn)品之間,抗體品質(zhì)差異都較為明顯,而且沒有統(tǒng)一的衡量標(biāo)準(zhǔn)。這是抗體選擇中zui難的一個(gè)問題。很多人習(xí)慣于根據(jù)實(shí)驗(yàn)室傳統(tǒng)意識(shí)或參考文獻(xiàn)上使用的產(chǎn)品進(jìn)行選擇,但是因?yàn)椴煌伍g的抗體效果也是有差異的,所以并不能*確保正確選擇。在這種情況下,抗體的售后就尤為重要,遇到抗體品質(zhì)障礙時(shí),能夠確保有效地解決問題,不至于影響實(shí)驗(yàn)的進(jìn)展?,F(xiàn)在有部分品牌可以提供免費(fèi)的抗體小樣的,無疑對這個(gè)問題是一個(gè)很好的解決方案。先確定抗體是否適合自己的實(shí)驗(yàn),可以避免因?yàn)榭贵w質(zhì)量投訴耽誤實(shí)驗(yàn)安排。在價(jià)格方面,需要謹(jǐn)記,zui貴的不一定就是的,你的實(shí)驗(yàn)的才是的?;ê芏噱X買到很貴的抗體,再花上很長的時(shí)間去投訴的情況并不少見。只買對的,不買貴的。在選擇價(jià)格的時(shí)候還要注意規(guī)格大小、抗體濃度、效價(jià)范圍等,要綜合考慮。在規(guī)格方面,根據(jù)zui終可以稀釋成的工作液的量的來衡量更為準(zhǔn)確。很多老品牌提供的抗體產(chǎn)品基本都是以大包裝為主,就單個(gè)課題的實(shí)驗(yàn)而言,過大的包裝有時(shí)會(huì)造成很大的浪費(fèi)。目前Proteintech、Bioworld、CellSignal等品牌都相繼推出小包裝的抗體,這在一定程度上給選擇者更大的選擇自由度,可以根據(jù)使用產(chǎn)品的效價(jià),計(jì)算出自己實(shí)際需要的抗體量,做到定量采購。四、關(guān)于品牌的選擇:因?yàn)榭贵w品質(zhì)的異質(zhì)化,關(guān)于抗體的品牌選擇就被大家所重視,但是不管是什么品牌都難免會(huì)遇到不適合自己實(shí)驗(yàn)的抗體。所以一般建議考慮那些業(yè)內(nèi)普遍認(rèn)可、購買方便、專業(yè)、售后處理便捷的品牌。一些甚至都沒有正式代理的,只能備選。同時(shí)購買時(shí)一定要找能夠提供產(chǎn)品指導(dǎo)、實(shí)驗(yàn)分析、售后處理的正規(guī)代理商購買,避免因?yàn)橘I到假貨水貨影響實(shí)驗(yàn)。
五、關(guān)于其他一些小細(xì)節(jié):抗體選擇與使用過程中,多少還會(huì)遇到一些意想不到的事情。有些細(xì)節(jié),還是需要多注意一些。如在選擇做阻斷或中和實(shí)驗(yàn)時(shí),有時(shí)需要將抗體加到細(xì)胞培養(yǎng)液中,這是需要注意抗體是否含有疊氮鈉。如果是大包裝的抗體,進(jìn)行分裝是比較節(jié)約的方式,如果是價(jià)的,可以配成母液再分裝??贵w的短時(shí)間運(yùn)輸,用普通冰塊保持溫度是可以滿足要求的。另外不要糾結(jié)于WB過程中分子量的問題。很多時(shí)候,我們看到同樣的抗體,不同的品牌,甚至同一品牌不同的貨號(hào),標(biāo)注的分子量都不一樣。其實(shí)可能只是生產(chǎn)商只檢測時(shí)使用了不同的種屬不同的樣品類型,或是參照了不同的文獻(xiàn),對使用者來說,同樣的樣品,不管使用哪個(gè)品牌的,只要抗體是對的,目的條帶只會(huì)出現(xiàn)在相同的位置。關(guān)于分子量的問題,一般不建議看產(chǎn)品說明,WB中條帶的位置由樣品決定,并不會(huì)因?yàn)榭贵w不同而不同。所以在檢測蛋白之前,我們可以通過數(shù)據(jù)庫或參考文獻(xiàn),對將要檢測的蛋白做個(gè)比較全面的了解,包括其可能剪切與修飾的情況、表型的情況等。在*次使用一個(gè)新的抗體時(shí),不要根據(jù)分子量橫向剪膜,可以保留幾個(gè)全泳道,看看條帶位置或分布的情況。